Wnętrze kościoła, pomimo zniszczeń wojennych, do dziś budzi ogromne wrażenie. Niezwykłości dodaje mu to, że pod jego posadzką znajduje się system kanałów. Kolejny, który po wielu latach ponownie ujrzał światło dzienne na początku 2022 roku, wykonano pomiędzy Muzeum a świątynią. Jest on widoczny na planach z 1912 roku, gdy wobecnym Muzeum znajdowała się kotłownia, która ogrzewała między innymi kościół. Wejście do kanału odsłonięto podczas prac archeologicznych, jednak jego istnienie wykazały wcześniejbadania endoskopowe w farze. Po starym systemie grzewczym pozostały jedynie resztki, jednak sam kanał przetrwał w dobrym stanie. Na zdjęciu poniżej znajduje się zakończenie kanału prowadzącego z Muzeum do kościoła.

Kanały w kościele powstały w latach 70. XX wieku. Z powodu odłączenia przedwojennego systemu grzewczego zbudowano wówczas dwa nowe kanały z wylotami tuż przed prezbiterium i wewnętrznymi drzwiami wejścia głównego. Ich łączna długość wynosi 70 metrów. Rozpoczynają się one w krypcie pod kaplicą w nawie północnej. Ich rozmieszczenie i kształt pokazują skany 3D wykonane przez Piotra Domagalskiego.